Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
LTBRP36941 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LTBRP36941 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LTBRP36941 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LTBRP36941 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LTBRP36941 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LTBRP36941 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LTBRP36941 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LTBRP36941 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LTBRP36941 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LTBRP36941 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LTBRP36941 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LTBRP36941 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LTBRP36941 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LTBRP36941 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LTBRP36941 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LTBRP36941 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LTBRP36941 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LTBRP36941 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LTBRP36941 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LTBRP36941 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LTBRP36941 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LTBRP36941 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LTBRP36941 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LTBRP36941 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LTBRP36941 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LTBRP36941 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LTBRP36941 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LTBRP36941 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LTBRP36941 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LTBRP36941 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LTBRP36941 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LTBRP36941 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LTBRP36941 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.53□□□□□ -2.32
LTBRP36941 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LTBRP36941 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LTBRP36941 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LTBRP36941 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LTBRP36941 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LTBRP36941 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LTBRP36941 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LTBRP36941 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LTBRP36941 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LTBRP36941 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LTBRP36941 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LTBRP36941 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
LTBRP36941 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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LTBRP36941 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
LTBRP36941 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
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LTBRP36941 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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LTBRP36941 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
LTBRP36941 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
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LTBRP36941 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LTBRP36941 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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LTBRP36941 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LTBRP36941 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LTBRP36941 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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LTBRP36941 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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LTBRP36941 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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LTBRP36941 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LTBRP36941 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LTBRP36941 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LTBRP36941 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LTBRP36941 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LTBRP36941 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LTBRP36941 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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