Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TSPOP30536 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TSPOP30536 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TSPOP30536 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TSPOP30536 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TSPOP30536 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TSPOP30536 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TSPOP30536 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TSPOP30536 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TSPOP30536 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TSPOP30536 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TSPOP30536 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TSPOP30536 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TSPOP30536 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TSPOP30536 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TSPOP30536 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TSPOP30536 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TSPOP30536 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TSPOP30536 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TSPOP30536 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TSPOP30536 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TSPOP30536 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TSPOP30536 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TSPOP30536 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TSPOP30536 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TSPOP30536 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TSPOP30536 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TSPOP30536 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TSPOP30536 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TSPOP30536 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TSPOP30536 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TSPOP30536 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TSPOP30536 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TSPOP30536 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TSPOP30536 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TSPOP30536 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-1.74□□□□□ -2.69
TSPOP30536 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TSPOP30536 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TSPOP30536 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TSPOP30536 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TSPOP30536 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TSPOP30536 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TSPOP30536 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TSPOP30536 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TSPOP30536 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TSPOP30536 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TSPOP30536 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TSPOP30536 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TSPOP30536 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TSPOP30536 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TSPOP30536 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TSPOP30536 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TSPOP30536 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TSPOP30536 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TSPOP30536 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TSPOP30536 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TSPOP30536 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TSPOP30536 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TSPOP30536 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TSPOP30536 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TSPOP30536 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TSPOP30536 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TSPOP30536 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TSPOP30536 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TSPOP30536 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TSPOP30536 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TSPOP30536 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TSPOP30536 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TSPOP30536 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TSPOP30536 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TSPOP30536 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TSPOP30536 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TSPOP30536 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TSPOP30536 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TSPOP30536 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TSPOP30536 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TSPOP30536 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TSPOP30536 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TSPOP30536 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TSPOP30536 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TSPOP30536 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TSPOP30536 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TSPOP30536 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TSPOP30536 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TSPOP30536 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TSPOP30536 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TSPOP30536 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TSPOP30536 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TSPOP30536 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TSPOP30536 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TSPOP30536 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TSPOP30536 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TSPOP30536 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TSPOP30536 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.83□□□□□ -2.7
TSPOP30536 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TSPOP30536 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TSPOP30536 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TSPOP30536 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TSPOP30536 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TSPOP30536 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
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