Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PRPF40AO75400 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PRPF40AO75400 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PRPF40AO75400 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PRPF40AO75400 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PRPF40AO75400 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PRPF40AO75400 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PRPF40AO75400 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PRPF40AO75400 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PRPF40AO75400 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PRPF40AO75400 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PRPF40AO75400 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PRPF40AO75400 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PRPF40AO75400 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PRPF40AO75400 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PRPF40AO75400 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PRPF40AO75400 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PRPF40AO75400 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PRPF40AO75400 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PRPF40AO75400 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PRPF40AO75400 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRPF40AO75400 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PRPF40AO75400 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PRPF40AO75400 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PRPF40AO75400 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
PRPF40AO75400 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRPF40AO75400 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRPF40AO75400 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRPF40AO75400 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRPF40AO75400 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRPF40AO75400 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRPF40AO75400 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRPF40AO75400 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRPF40AO75400 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRPF40AO75400 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRPF40AO75400 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRPF40AO75400 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PRPF40AO75400 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PRPF40AO75400 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PRPF40AO75400 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF40AO75400 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF40AO75400 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF40AO75400 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF40AO75400 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF40AO75400 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF40AO75400 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRPF40AO75400 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRPF40AO75400 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRPF40AO75400 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PRPF40AO75400 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRPF40AO75400 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRPF40AO75400 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRPF40AO75400 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRPF40AO75400 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRPF40AO75400 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRPF40AO75400 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRPF40AO75400 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRPF40AO75400 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRPF40AO75400 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRPF40AO75400 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRPF40AO75400 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRPF40AO75400 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRPF40AO75400 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRPF40AO75400 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRPF40AO75400 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRPF40AO75400 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRPF40AO75400 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRPF40AO75400 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRPF40AO75400 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRPF40AO75400 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRPF40AO75400 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRPF40AO75400 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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