Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAMP4O75379 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAMP4O75379 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VAMP4O75379 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VAMP4O75379 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VAMP4O75379 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VAMP4O75379 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VAMP4O75379 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VAMP4O75379 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VAMP4O75379 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAMP4O75379 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VAMP4O75379 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAMP4O75379 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAMP4O75379 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAMP4O75379 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VAMP4O75379 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
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VAMP4O75379 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VAMP4O75379 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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VAMP4O75379 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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VAMP4O75379 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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VAMP4O75379 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAMP4O75379 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAMP4O75379 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
VAMP4O75379 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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VAMP4O75379 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAMP4O75379 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAMP4O75379 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAMP4O75379 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAMP4O75379 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAMP4O75379 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAMP4O75379 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
VAMP4O75379 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAMP4O75379 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAMP4O75379 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAMP4O75379 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAMP4O75379 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAMP4O75379 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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