Protein–RNA interactions for Protein: O14717

TRDMT1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1O14717 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.76□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TRDMT1O14717 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.81□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.84□□□□□ -2.7
TRDMT1O14717 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TRDMT1O14717 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258.6 ms