Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-3.41□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
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