Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MEIS3Q99687 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.54□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MEIS3Q99687 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.51□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MEIS3Q99687 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MEIS3Q99687 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MEIS3Q99687 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MEIS3Q99687 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
MEIS3Q99687 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MEIS3Q99687 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MEIS3Q99687 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MEIS3Q99687 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MEIS3Q99687 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MEIS3Q99687 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MEIS3Q99687 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MEIS3Q99687 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
MEIS3Q99687 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.9 ms