Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
USP53Q70EK8 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
USP53Q70EK8 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
USP53Q70EK8 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
USP53Q70EK8 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
USP53Q70EK8 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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USP53Q70EK8 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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USP53Q70EK8 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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USP53Q70EK8 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USP53Q70EK8 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USP53Q70EK8 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
USP53Q70EK8 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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USP53Q70EK8 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
USP53Q70EK8 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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