Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CSPP1Q1MSJ5 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CSPP1Q1MSJ5 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CSPP1Q1MSJ5 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CSPP1Q1MSJ5 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CSPP1Q1MSJ5 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CSPP1Q1MSJ5 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CSPP1Q1MSJ5 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CSPP1Q1MSJ5 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CSPP1Q1MSJ5 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CSPP1Q1MSJ5 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CSPP1Q1MSJ5 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CSPP1Q1MSJ5 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CSPP1Q1MSJ5 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CSPP1Q1MSJ5 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CSPP1Q1MSJ5 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CSPP1Q1MSJ5 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CSPP1Q1MSJ5 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CSPP1Q1MSJ5 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CSPP1Q1MSJ5 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CSPP1Q1MSJ5 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CSPP1Q1MSJ5 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CSPP1Q1MSJ5 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CSPP1Q1MSJ5 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CSPP1Q1MSJ5 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CSPP1Q1MSJ5 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
CSPP1Q1MSJ5 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CSPP1Q1MSJ5 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CSPP1Q1MSJ5 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CSPP1Q1MSJ5 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CSPP1Q1MSJ5 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CSPP1Q1MSJ5 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
CSPP1Q1MSJ5 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CSPP1Q1MSJ5 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CSPP1Q1MSJ5 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CSPP1Q1MSJ5 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CSPP1Q1MSJ5 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CSPP1Q1MSJ5 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CSPP1Q1MSJ5 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CSPP1Q1MSJ5 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CSPP1Q1MSJ5 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CSPP1Q1MSJ5 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CSPP1Q1MSJ5 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CSPP1Q1MSJ5 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSPP1Q1MSJ5 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CSPP1Q1MSJ5 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSPP1Q1MSJ5 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSPP1Q1MSJ5 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CSPP1Q1MSJ5 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CSPP1Q1MSJ5 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CSPP1Q1MSJ5 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CSPP1Q1MSJ5 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CSPP1Q1MSJ5 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CSPP1Q1MSJ5 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CSPP1Q1MSJ5 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CSPP1Q1MSJ5 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CSPP1Q1MSJ5 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CSPP1Q1MSJ5 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CSPP1Q1MSJ5 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CSPP1Q1MSJ5 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CSPP1Q1MSJ5 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CSPP1Q1MSJ5 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CSPP1Q1MSJ5 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSPP1Q1MSJ5 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSPP1Q1MSJ5 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CSPP1Q1MSJ5 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CSPP1Q1MSJ5 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CSPP1Q1MSJ5 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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