Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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PTPRNQ16849 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRNQ16849 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRNQ16849 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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PTPRNQ16849 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRNQ16849 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
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PTPRNQ16849 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRNQ16849 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRNQ16849 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRNQ16849 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRNQ16849 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRNQ16849 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRNQ16849 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRNQ16849 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRNQ16849 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRNQ16849 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRNQ16849 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRNQ16849 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRNQ16849 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRNQ16849 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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PTPRNQ16849 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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PTPRNQ16849 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRNQ16849 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRNQ16849 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRNQ16849 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRNQ16849 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRNQ16849 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRNQ16849 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRNQ16849 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRNQ16849 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
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PTPRNQ16849 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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PTPRNQ16849 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
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PTPRNQ16849 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
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PTPRNQ16849 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRNQ16849 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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PTPRNQ16849 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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PTPRNQ16849 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
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PTPRNQ16849 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRNQ16849 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRNQ16849 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
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PTPRNQ16849 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRNQ16849 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRNQ16849 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRNQ16849 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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