Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD1Q16676 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD1Q16676 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXD1Q16676 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD1Q16676 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD1Q16676 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXD1Q16676 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXD1Q16676 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
FOXD1Q16676 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD1Q16676 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD1Q16676 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD1Q16676 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD1Q16676 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD1Q16676 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD1Q16676 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD1Q16676 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD1Q16676 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD1Q16676 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD1Q16676 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD1Q16676 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD1Q16676 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD1Q16676 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD1Q16676 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD1Q16676 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD1Q16676 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD1Q16676 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD1Q16676 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD1Q16676 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD1Q16676 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD1Q16676 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD1Q16676 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD1Q16676 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD1Q16676 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXD1Q16676 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXD1Q16676 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXD1Q16676 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXD1Q16676 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXD1Q16676 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXD1Q16676 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD1Q16676 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD1Q16676 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD1Q16676 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD1Q16676 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD1Q16676 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD1Q16676 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD1Q16676 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD1Q16676 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD1Q16676 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD1Q16676 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD1Q16676 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD1Q16676 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD1Q16676 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD1Q16676 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD1Q16676 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD1Q16676 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD1Q16676 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD1Q16676 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD1Q16676 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD1Q16676 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD1Q16676 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXD1Q16676 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXD1Q16676 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXD1Q16676 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXD1Q16676 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXD1Q16676 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXD1Q16676 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXD1Q16676 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXD1Q16676 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXD1Q16676 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXD1Q16676 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXD1Q16676 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXD1Q16676 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXD1Q16676 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD1Q16676 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXD1Q16676 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXD1Q16676 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
FOXD1Q16676 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXD1Q16676 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXD1Q16676 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXD1Q16676 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXD1Q16676 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXD1Q16676 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXD1Q16676 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXD1Q16676 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXD1Q16676 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXD1Q16676 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXD1Q16676 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD1Q16676 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD1Q16676 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD1Q16676 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD1Q16676 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD1Q16676 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD1Q16676 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXD1Q16676 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXD1Q16676 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXD1Q16676 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXD1Q16676 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD1Q16676 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD1Q16676 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD1Q16676 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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