RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: Q16384
SSX1, Protein SSX1, human
Predictions only
Length
188 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SSX1
Q16384
Y_RNA.580-201
ENST00000391004
95 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
SSX1
Q16384
RNU6-1246P-201
ENST00000391064
107 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
SSX1
Q16384
SNORD57-201
ENST00000448188
72 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
SSX1
Q16384
RNU7-120P-201
ENST00000459334
63 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
SSX1
Q16384
MIR4439-201
ENST00000583746
80 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
SSX1
Q16384
RNY3P2-201
ENST00000362918
102 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
SSX1
Q16384
RNU4-32P-201
ENST00000363404
141 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
SSX1
Q16384
SNORD58C-201
ENST00000365223
64 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
SSX1
Q16384
Y_RNA.491-201
ENST00000384417
107 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
SSX1
Q16384
RNU6-644P-201
ENST00000391155
98 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
SSX1
Q16384
SNORD4B-201
ENST00000459083
72 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
SSX1
Q16384
MIR4306-201
ENST00000583390
91 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
SSX1
Q16384
MIR4320-201
ENST00000636981
65 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
SSX1
Q16384
MIR548X2-201
ENST00000579776
100 nt
BASIC
-1.45
□□□□□ -2.64
SSX1
Q16384
MIR3613-201
ENST00000579844
87 nt
BASIC
-1.45
□□□□□ -2.64
SSX1
Q16384
AL445584.3-201
ENST00000617173
78 nt
BASIC
-1.45
□□□□□ -2.64
SSX1
Q16384
RNU6-1290P-201
ENST00000362957
109 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
SSX1
Q16384
SNORA63-201
ENST00000363450
132 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
SSX1
Q16384
MIR6888-201
ENST00000621977
67 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
SSX1
Q16384
AL118496.2-201
ENST00000448300
230 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
SSX1
Q16384
RNU6-62P-201
ENST00000516526
102 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
SSX1
Q16384
RNU6-1061P-201
ENST00000516530
99 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
SSX1
Q16384
SNORD116-18-201
ENST00000383961
92 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
MIR4679-2-201
ENST00000578358
77 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
MIR548Z-201
ENST00000584743
97 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
AC103810.7-201
ENST00000607821
91 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
AL035470.1-201
ENST00000622571
220 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
MIR409-201
ENST00000362237
79 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
Y_RNA.193-201
ENST00000363979
102 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
SNORD45B-201
ENST00000364617
72 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
RNU6-382P-201
ENST00000365181
106 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
SNORA15B-2-201
ENST00000384058
135 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
RNU6-260P-201
ENST00000384092
107 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
SNORA15B-1-201
ENST00000384334
135 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
RNU6-813P-201
ENST00000384691
107 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
RNA5SP292-201
ENST00000390974
118 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
SNORD90-201
ENST00000391145
111 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
snoU13.17-201
ENST00000458802
104 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
AC006254.2-201
ENST00000603259
279 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
Y_RNA.346-201
ENST00000365385
112 nt
BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
RNU6-1157P-201
ENST00000384456
106 nt
BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
RNU6-394P-201
ENST00000410735
107 nt
BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
Y_RNA.95-201
ENST00000363079
95 nt
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
RNU6ATAC29P-201
ENST00000408088
125 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
MIR1255B2-201
ENST00000408618
67 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
RNU6-519P-201
ENST00000410590
108 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
MTATP6P29-201
ENST00000415057
132 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
RNA5SP476-201
ENST00000516613
103 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
SNORA18.5-201
ENST00000516616
101 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
MIR4503-201
ENST00000582187
83 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
SNORA33.1-201
ENST00000364957
130 nt
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
RNU6-1039P-201
ENST00000383931
107 nt
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
Y_RNA.467-201
ENST00000384297
102 nt
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
MIR569-201
ENST00000385228
96 nt
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
Y_RNA.630-201
ENST00000411370
108 nt
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
RNA5SP147-201
ENST00000516493
109 nt
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
SSX1
Q16384
RNU6-924P-201
ENST00000362926
108 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
Y_RNA.178-201
ENST00000363832
102 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
Y_RNA.250-201
ENST00000364542
110 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
Y_RNA.400-201
ENST00000383963
111 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
Y_RNA.489-201
ENST00000384410
101 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
TRAJ30-201
ENST00000390507
57 nt
APPRIS P1
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
MTND3P2-201
ENST00000438452
342 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
RNU6-200P-201
ENST00000364743
107 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
Y_RNA.563-201
ENST00000384707
108 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
MIR203A-201
ENST00000384836
110 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
RNA5SP266-201
ENST00000410273
108 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
Y_RNA.604-201
ENST00000410574
102 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
HAR1A.1-201
ENST00000459583
118 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
CYP3A54P-201
ENST00000566950
75 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
MIR6509-201
ENST00000614603
85 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
MIR4773-1-201
ENST00000637203
78 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
Y_RNA.29-201
ENST00000362570
113 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
SNORA2.1-201
ENST00000363089
137 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
RNU6-824P-201
ENST00000363724
104 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
Y_RNA.452-201
ENST00000384202
108 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
Y_RNA.468-201
ENST00000384298
102 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
MIR548I1-201
ENST00000408810
149 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
RNU6-327P-201
ENST00000516270
127 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
Y_RNA.698-201
ENST00000516798
118 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
RNU6-706P-201
ENST00000517229
104 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
MIR3657-201
ENST00000584818
117 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
RNU6-804P-201
ENST00000384286
107 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
RNU6-196P-201
ENST00000384315
107 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
SNORA26.4-201
ENST00000391188
123 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
RNU6-772P-201
ENST00000516042
105 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
RNA5SP272-201
ENST00000516095
111 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
MIR5009-201
ENST00000578736
100 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
MIR3144-201
ENST00000579460
79 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
MIR4777-201
ENST00000583710
86 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
HOTAIRM1_3.1-201
ENST00000619974
59 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
Y_RNA.8-201
ENST00000362353
102 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
SNORD115-33-201
ENST00000363723
82 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
RNU6-1014P-201
ENST00000383940
103 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
Y_RNA.398-201
ENST00000383952
99 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
RNU6-746P-201
ENST00000384112
109 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
SNORD63.1-201
ENST00000516178
80 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
AC004792.1-201
ENST00000614523
137 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
SSX1
Q16384
AL157777.2-201
ENST00000258070
137 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
SSX1
Q16384
RNU5F-1-201
ENST00000362507
117 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
First
Previous
978
Next
Last
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.3 ms