Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
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RIPK1Q13546 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
RIPK1Q13546 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
RIPK1Q13546 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
RIPK1Q13546 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
RIPK1Q13546 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
RIPK1Q13546 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
RIPK1Q13546 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
RIPK1Q13546 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
RIPK1Q13546 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
RIPK1Q13546 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
RIPK1Q13546 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
RIPK1Q13546 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
RIPK1Q13546 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
RIPK1Q13546 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
RIPK1Q13546 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
RIPK1Q13546 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
RIPK1Q13546 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
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RIPK1Q13546 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
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RIPK1Q13546 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
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RIPK1Q13546 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RIPK1Q13546 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
RIPK1Q13546 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
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RIPK1Q13546 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
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RIPK1Q13546 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
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RIPK1Q13546 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
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RIPK1Q13546 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
RIPK1Q13546 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
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RIPK1Q13546 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
RIPK1Q13546 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
RIPK1Q13546 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RIPK1Q13546 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RIPK1Q13546 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RIPK1Q13546 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RIPK1Q13546 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RIPK1Q13546 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RIPK1Q13546 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RIPK1Q13546 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RIPK1Q13546 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RIPK1Q13546 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
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