Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
ATRQ13535 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
ATRQ13535 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC-1.76□□□□□ -2.69
ATRQ13535 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
ATRQ13535 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
ATRQ13535 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
ATRQ13535 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
ATRQ13535 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ATRQ13535 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ATRQ13535 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ATRQ13535 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ATRQ13535 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ATRQ13535 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ATRQ13535 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ATRQ13535 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ATRQ13535 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ATRQ13535 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
ATRQ13535 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ATRQ13535 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ATRQ13535 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ATRQ13535 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ATRQ13535 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ATRQ13535 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ATRQ13535 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ATRQ13535 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ATRQ13535 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ATRQ13535 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ATRQ13535 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ATRQ13535 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ATRQ13535 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ATRQ13535 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ATRQ13535 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ATRQ13535 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATRQ13535 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATRQ13535 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATRQ13535 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATRQ13535 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATRQ13535 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATRQ13535 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATRQ13535 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATRQ13535 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATRQ13535 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATRQ13535 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATRQ13535 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATRQ13535 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATRQ13535 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATRQ13535 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATRQ13535 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATRQ13535 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATRQ13535 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATRQ13535 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATRQ13535 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATRQ13535 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATRQ13535 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATRQ13535 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATRQ13535 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATRQ13535 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATRQ13535 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATRQ13535 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATRQ13535 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATRQ13535 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATRQ13535 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATRQ13535 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATRQ13535 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATRQ13535 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATRQ13535 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATRQ13535 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATRQ13535 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
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