Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-3.34□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
CPSF1Q10570 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
CPSF1Q10570 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
CPSF1Q10570 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
CPSF1Q10570 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
CPSF1Q10570 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
CPSF1Q10570 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
CPSF1Q10570 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
CPSF1Q10570 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
CPSF1Q10570 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
CPSF1Q10570 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
CPSF1Q10570 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
CPSF1Q10570 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
CPSF1Q10570 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
CPSF1Q10570 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
CPSF1Q10570 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
CPSF1Q10570 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
CPSF1Q10570 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
CPSF1Q10570 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
CPSF1Q10570 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
CPSF1Q10570 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
CPSF1Q10570 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
CPSF1Q10570 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
CPSF1Q10570 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
CPSF1Q10570 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
CPSF1Q10570 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
CPSF1Q10570 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
CPSF1Q10570 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
CPSF1Q10570 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
CPSF1Q10570 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
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