Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRXP46100 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRXP46100 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRXP46100 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRXP46100 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRXP46100 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRXP46100 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRXP46100 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRXP46100 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRXP46100 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRXP46100 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRXP46100 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRXP46100 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRXP46100 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRXP46100 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRXP46100 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRXP46100 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRXP46100 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRXP46100 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRXP46100 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRXP46100 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRXP46100 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRXP46100 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ATRXP46100 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRXP46100 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRXP46100 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRXP46100 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRXP46100 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRXP46100 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRXP46100 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRXP46100 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ATRXP46100 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ATRXP46100 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ATRXP46100 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ATRXP46100 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ATRXP46100 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ATRXP46100 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRXP46100 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRXP46100 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRXP46100 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRXP46100 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRXP46100 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRXP46100 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRXP46100 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRXP46100 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRXP46100 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRXP46100 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRXP46100 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRXP46100 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRXP46100 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRXP46100 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRXP46100 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRXP46100 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRXP46100 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRXP46100 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRXP46100 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRXP46100 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRXP46100 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRXP46100 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRXP46100 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRXP46100 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRXP46100 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRXP46100 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRXP46100 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRXP46100 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRXP46100 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRXP46100 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRXP46100 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRXP46100 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRXP46100 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRXP46100 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRXP46100 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRXP46100 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRXP46100 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRXP46100 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRXP46100 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRXP46100 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRXP46100 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRXP46100 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRXP46100 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRXP46100 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRXP46100 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRXP46100 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRXP46100 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRXP46100 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRXP46100 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRXP46100 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRXP46100 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRXP46100 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRXP46100 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRXP46100 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRXP46100 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRXP46100 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRXP46100 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRXP46100 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRXP46100 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRXP46100 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRXP46100 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRXP46100 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATRXP46100 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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