Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
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PTPRMP28827 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-2.63□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
PTPRMP28827 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
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PTPRMP28827 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
PTPRMP28827 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
PTPRMP28827 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-2.66□□□□□ -2.84
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PTPRMP28827 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
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PTPRMP28827 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
PTPRMP28827 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
PTPRMP28827 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
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PTPRMP28827 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
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PTPRMP28827 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
PTPRMP28827 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
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PTPRMP28827 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
PTPRMP28827 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
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