Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BRPF3Q9ULD4 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BRPF3Q9ULD4 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BRPF3Q9ULD4 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BRPF3Q9ULD4 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
BRPF3Q9ULD4 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BRPF3Q9ULD4 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BRPF3Q9ULD4 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BRPF3Q9ULD4 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BRPF3Q9ULD4 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BRPF3Q9ULD4 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BRPF3Q9ULD4 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BRPF3Q9ULD4 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BRPF3Q9ULD4 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BRPF3Q9ULD4 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BRPF3Q9ULD4 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BRPF3Q9ULD4 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
BRPF3Q9ULD4 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BRPF3Q9ULD4 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BRPF3Q9ULD4 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BRPF3Q9ULD4 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BRPF3Q9ULD4 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BRPF3Q9ULD4 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
BRPF3Q9ULD4 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BRPF3Q9ULD4 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BRPF3Q9ULD4 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BRPF3Q9ULD4 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BRPF3Q9ULD4 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BRPF3Q9ULD4 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BRPF3Q9ULD4 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
BRPF3Q9ULD4 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
BRPF3Q9ULD4 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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