Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PDGFDQ9GZP0 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDGFDQ9GZP0 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDGFDQ9GZP0 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDGFDQ9GZP0 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDGFDQ9GZP0 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PDGFDQ9GZP0 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDGFDQ9GZP0 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDGFDQ9GZP0 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDGFDQ9GZP0 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDGFDQ9GZP0 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDGFDQ9GZP0 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDGFDQ9GZP0 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDGFDQ9GZP0 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDGFDQ9GZP0 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PDGFDQ9GZP0 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDGFDQ9GZP0 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDGFDQ9GZP0 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDGFDQ9GZP0 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDGFDQ9GZP0 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDGFDQ9GZP0 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDGFDQ9GZP0 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDGFDQ9GZP0 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDGFDQ9GZP0 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
PDGFDQ9GZP0 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDGFDQ9GZP0 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDGFDQ9GZP0 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDGFDQ9GZP0 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDGFDQ9GZP0 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDGFDQ9GZP0 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDGFDQ9GZP0 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDGFDQ9GZP0 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDGFDQ9GZP0 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDGFDQ9GZP0 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PDGFDQ9GZP0 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PDGFDQ9GZP0 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PDGFDQ9GZP0 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PDGFDQ9GZP0 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PDGFDQ9GZP0 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDGFDQ9GZP0 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDGFDQ9GZP0 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDGFDQ9GZP0 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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