Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.56□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.57□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182 ms