Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SMN1Q16637 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMN1Q16637 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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