Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCARF1Q14162 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SCARF1Q14162 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCARF1Q14162 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCARF1Q14162 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCARF1Q14162 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCARF1Q14162 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCARF1Q14162 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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