Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEUROD1Q13562 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEUROD1Q13562 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NEUROD1Q13562 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NEUROD1Q13562 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NEUROD1Q13562 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NEUROD1Q13562 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NEUROD1Q13562 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NEUROD1Q13562 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NEUROD1Q13562 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
NEUROD1Q13562 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEUROD1Q13562 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEUROD1Q13562 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEUROD1Q13562 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEUROD1Q13562 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NEUROD1Q13562 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NEUROD1Q13562 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NEUROD1Q13562 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NEUROD1Q13562 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEUROD1Q13562 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEUROD1Q13562 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEUROD1Q13562 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEUROD1Q13562 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEUROD1Q13562 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NEUROD1Q13562 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NEUROD1Q13562 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEUROD1Q13562 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEUROD1Q13562 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEUROD1Q13562 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEUROD1Q13562 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEUROD1Q13562 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEUROD1Q13562 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEUROD1Q13562 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NEUROD1Q13562 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NEUROD1Q13562 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NEUROD1Q13562 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEUROD1Q13562 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NEUROD1Q13562 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEUROD1Q13562 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEUROD1Q13562 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEUROD1Q13562 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEUROD1Q13562 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NEUROD1Q13562 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NEUROD1Q13562 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NEUROD1Q13562 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NEUROD1Q13562 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NEUROD1Q13562 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NEUROD1Q13562 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NEUROD1Q13562 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NEUROD1Q13562 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NEUROD1Q13562 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NEUROD1Q13562 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NEUROD1Q13562 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEUROD1Q13562 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEUROD1Q13562 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEUROD1Q13562 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NEUROD1Q13562 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NEUROD1Q13562 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NEUROD1Q13562 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NEUROD1Q13562 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NEUROD1Q13562 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NEUROD1Q13562 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
NEUROD1Q13562 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NEUROD1Q13562 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NEUROD1Q13562 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NEUROD1Q13562 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NEUROD1Q13562 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NEUROD1Q13562 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NEUROD1Q13562 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NEUROD1Q13562 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NEUROD1Q13562 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
NEUROD1Q13562 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEUROD1Q13562 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEUROD1Q13562 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEUROD1Q13562 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEUROD1Q13562 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEUROD1Q13562 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEUROD1Q13562 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEUROD1Q13562 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEUROD1Q13562 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NEUROD1Q13562 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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