Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-2.52□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-2.53□□□□□ -2.81
TCOF1Q13428 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-2.55□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TCOF1Q13428 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-2.61□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TCOF1Q13428 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
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