Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
XRCC4Q13426 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
XRCC4Q13426 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
XRCC4Q13426 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.66□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
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