Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SKP2Q13309 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SKP2Q13309 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SKP2Q13309 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.23□□□□□ -2.61
SKP2Q13309 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SKP2Q13309 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SKP2Q13309 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SKP2Q13309 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SKP2Q13309 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
SKP2Q13309 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SKP2Q13309 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SKP2Q13309 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SKP2Q13309 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SKP2Q13309 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SKP2Q13309 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SKP2Q13309 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SKP2Q13309 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
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SKP2Q13309 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SKP2Q13309 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SKP2Q13309 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SKP2Q13309 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
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SKP2Q13309 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SKP2Q13309 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
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SKP2Q13309 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SKP2Q13309 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
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SKP2Q13309 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
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SKP2Q13309 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SKP2Q13309 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SKP2Q13309 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SKP2Q13309 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
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SKP2Q13309 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
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SKP2Q13309 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
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