Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.56□□□□□ -2.32
KIF5AQ12840 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KIF5AQ12840 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KIF5AQ12840 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KIF5AQ12840 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KIF5AQ12840 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KIF5AQ12840 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KIF5AQ12840 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KIF5AQ12840 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KIF5AQ12840 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KIF5AQ12840 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KIF5AQ12840 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
KIF5AQ12840 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
KIF5AQ12840 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
KIF5AQ12840 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
KIF5AQ12840 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
KIF5AQ12840 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
KIF5AQ12840 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
KIF5AQ12840 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
KIF5AQ12840 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
KIF5AQ12840 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
KIF5AQ12840 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
KIF5AQ12840 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
KIF5AQ12840 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
KIF5AQ12840 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
KIF5AQ12840 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
KIF5AQ12840 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
KIF5AQ12840 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KIF5AQ12840 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
KIF5AQ12840 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.9 ms