Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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