Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-1.46□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.48□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TOP1MTQ969P6 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
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