Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GEN1Q17RS7 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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GEN1Q17RS7 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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GEN1Q17RS7 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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GEN1Q17RS7 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GEN1Q17RS7 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GEN1Q17RS7 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GEN1Q17RS7 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
GEN1Q17RS7 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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GEN1Q17RS7 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GEN1Q17RS7 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GEN1Q17RS7 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GEN1Q17RS7 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GEN1Q17RS7 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GEN1Q17RS7 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GEN1Q17RS7 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GEN1Q17RS7 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GEN1Q17RS7 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GEN1Q17RS7 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GEN1Q17RS7 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GEN1Q17RS7 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GEN1Q17RS7 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GEN1Q17RS7 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GEN1Q17RS7 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GEN1Q17RS7 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GEN1Q17RS7 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GEN1Q17RS7 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GEN1Q17RS7 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GEN1Q17RS7 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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