Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ZIC1Q15915 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZIC1Q15915 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.7 ms