Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
VPS72Q15906 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
VPS72Q15906 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
VPS72Q15906 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
VPS72Q15906 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
VPS72Q15906 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
VPS72Q15906 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
VPS72Q15906 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
VPS72Q15906 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
VPS72Q15906 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
VPS72Q15906 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
VPS72Q15906 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
VPS72Q15906 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
VPS72Q15906 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
VPS72Q15906 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
VPS72Q15906 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
VPS72Q15906 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
VPS72Q15906 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
VPS72Q15906 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
VPS72Q15906 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
VPS72Q15906 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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VPS72Q15906 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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VPS72Q15906 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VPS72Q15906 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VPS72Q15906 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VPS72Q15906 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VPS72Q15906 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VPS72Q15906 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VPS72Q15906 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VPS72Q15906 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VPS72Q15906 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
VPS72Q15906 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VPS72Q15906 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VPS72Q15906 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VPS72Q15906 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VPS72Q15906 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VPS72Q15906 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VPS72Q15906 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VPS72Q15906 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VPS72Q15906 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VPS72Q15906 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VPS72Q15906 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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