Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-3.61□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-3.63□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
ITSN1Q15811 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
ITSN1Q15811 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
ITSN1Q15811 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
ITSN1Q15811 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
ITSN1Q15811 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
ITSN1Q15811 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
ITSN1Q15811 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
ITSN1Q15811 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
ITSN1Q15811 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
ITSN1Q15811 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
ITSN1Q15811 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
ITSN1Q15811 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
ITSN1Q15811 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
ITSN1Q15811 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
ITSN1Q15811 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
ITSN1Q15811 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
ITSN1Q15811 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
ITSN1Q15811 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
ITSN1Q15811 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
ITSN1Q15811 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
ITSN1Q15811 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
ITSN1Q15811 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
ITSN1Q15811 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
ITSN1Q15811 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
ITSN1Q15811 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
ITSN1Q15811 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
ITSN1Q15811 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
ITSN1Q15811 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
ITSN1Q15811 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
ITSN1Q15811 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
ITSN1Q15811 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
ITSN1Q15811 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
ITSN1Q15811 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
ITSN1Q15811 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
ITSN1Q15811 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
ITSN1Q15811 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
ITSN1Q15811 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
ITSN1Q15811 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
ITSN1Q15811 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC-3.75□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
ITSN1Q15811 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-3.77□□□□□ -3.01
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