Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SKIV2LQ15477 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SKIV2LQ15477 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SKIV2LQ15477 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
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