Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-3.17□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-3.18□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SHPRHQ149N8 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SHPRHQ149N8 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SHPRHQ149N8 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-3.23□□□□□ -2.93
SHPRHQ149N8 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SHPRHQ149N8 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SHPRHQ149N8 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SHPRHQ149N8 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
SHPRHQ149N8 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
SHPRHQ149N8 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
SHPRHQ149N8 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
SHPRHQ149N8 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
SHPRHQ149N8 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
SHPRHQ149N8 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
SHPRHQ149N8 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
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SHPRHQ149N8 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
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SHPRHQ149N8 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
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SHPRHQ149N8 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SHPRHQ149N8 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SHPRHQ149N8 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
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SHPRHQ149N8 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-3.27□□□□□ -2.93
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SHPRHQ149N8 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SHPRHQ149N8 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SHPRHQ149N8 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SHPRHQ149N8 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SHPRHQ149N8 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
SHPRHQ149N8 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
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SHPRHQ149N8 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
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SHPRHQ149N8 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SHPRHQ149N8 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
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