Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CAPRIN1Q14444 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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CAPRIN1Q14444 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CAPRIN1Q14444 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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