Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TUBB3Q13509 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TUBB3Q13509 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TUBB3Q13509 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TUBB3Q13509 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TUBB3Q13509 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TUBB3Q13509 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TUBB3Q13509 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TUBB3Q13509 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TUBB3Q13509 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TUBB3Q13509 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TUBB3Q13509 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TUBB3Q13509 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TUBB3Q13509 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TUBB3Q13509 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TUBB3Q13509 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TUBB3Q13509 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TUBB3Q13509 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TUBB3Q13509 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TUBB3Q13509 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TUBB3Q13509 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TUBB3Q13509 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
TUBB3Q13509 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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TUBB3Q13509 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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TUBB3Q13509 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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TUBB3Q13509 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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TUBB3Q13509 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TUBB3Q13509 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
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