Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GRIK2Q13002 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
GRIK2Q13002 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
GRIK2Q13002 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
GRIK2Q13002 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
GRIK2Q13002 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
GRIK2Q13002 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
GRIK2Q13002 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GRIK2Q13002 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GRIK2Q13002 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GRIK2Q13002 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GRIK2Q13002 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GRIK2Q13002 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GRIK2Q13002 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GRIK2Q13002 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
GRIK2Q13002 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GRIK2Q13002 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GRIK2Q13002 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GRIK2Q13002 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GRIK2Q13002 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GRIK2Q13002 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GRIK2Q13002 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GRIK2Q13002 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GRIK2Q13002 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GRIK2Q13002 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GRIK2Q13002 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GRIK2Q13002 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GRIK2Q13002 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GRIK2Q13002 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.9 ms