Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VDRP11473 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VDRP11473 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VDRP11473 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VDRP11473 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VDRP11473 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VDRP11473 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VDRP11473 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VDRP11473 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VDRP11473 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VDRP11473 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VDRP11473 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VDRP11473 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VDRP11473 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VDRP11473 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VDRP11473 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VDRP11473 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VDRP11473 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VDRP11473 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VDRP11473 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VDRP11473 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VDRP11473 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VDRP11473 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VDRP11473 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VDRP11473 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VDRP11473 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VDRP11473 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VDRP11473 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VDRP11473 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VDRP11473 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VDRP11473 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VDRP11473 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VDRP11473 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VDRP11473 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VDRP11473 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VDRP11473 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VDRP11473 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VDRP11473 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VDRP11473 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VDRP11473 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VDRP11473 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VDRP11473 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VDRP11473 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VDRP11473 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VDRP11473 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VDRP11473 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VDRP11473 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VDRP11473 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
VDRP11473 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VDRP11473 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VDRP11473 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VDRP11473 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VDRP11473 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VDRP11473 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VDRP11473 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
VDRP11473 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VDRP11473 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VDRP11473 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VDRP11473 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VDRP11473 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VDRP11473 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VDRP11473 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VDRP11473 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VDRP11473 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VDRP11473 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VDRP11473 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VDRP11473 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VDRP11473 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VDRP11473 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VDRP11473 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VDRP11473 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VDRP11473 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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