Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
MEIS1O00470 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
MEIS1O00470 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
MEIS1O00470 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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