Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
LTBP3Q9NS15 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
LTBP3Q9NS15 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.7 ms