Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CPEB1Q9BZB8 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CPEB1Q9BZB8 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CPEB1Q9BZB8 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CPEB1Q9BZB8 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CPEB1Q9BZB8 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CPEB1Q9BZB8 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CPEB1Q9BZB8 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CPEB1Q9BZB8 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CPEB1Q9BZB8 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CPEB1Q9BZB8 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CPEB1Q9BZB8 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CPEB1Q9BZB8 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CPEB1Q9BZB8 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CPEB1Q9BZB8 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CPEB1Q9BZB8 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CPEB1Q9BZB8 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CPEB1Q9BZB8 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CPEB1Q9BZB8 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CPEB1Q9BZB8 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CPEB1Q9BZB8 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CPEB1Q9BZB8 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CPEB1Q9BZB8 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CPEB1Q9BZB8 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CPEB1Q9BZB8 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CPEB1Q9BZB8 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CPEB1Q9BZB8 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 272.3 ms