Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
USP53Q70EK8 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
USP53Q70EK8 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
USP53Q70EK8 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
USP53Q70EK8 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USP53Q70EK8 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
USP53Q70EK8 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USP53Q70EK8 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USP53Q70EK8 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
USP53Q70EK8 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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USP53Q70EK8 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USP53Q70EK8 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USP53Q70EK8 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USP53Q70EK8 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USP53Q70EK8 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USP53Q70EK8 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
USP53Q70EK8 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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USP53Q70EK8 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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USP53Q70EK8 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
USP53Q70EK8 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
USP53Q70EK8 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
USP53Q70EK8 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
USP53Q70EK8 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
USP53Q70EK8 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
USP53Q70EK8 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
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USP53Q70EK8 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
USP53Q70EK8 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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USP53Q70EK8 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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USP53Q70EK8 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
USP53Q70EK8 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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USP53Q70EK8 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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USP53Q70EK8 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
USP53Q70EK8 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
USP53Q70EK8 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
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USP53Q70EK8 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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USP53Q70EK8 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
USP53Q70EK8 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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USP53Q70EK8 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
USP53Q70EK8 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
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USP53Q70EK8 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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USP53Q70EK8 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
USP53Q70EK8 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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