Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SLC18A3Q16572 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SLC18A3Q16572 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SLC18A3Q16572 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SLC18A3Q16572 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SLC18A3Q16572 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SLC18A3Q16572 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SLC18A3Q16572 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SLC18A3Q16572 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SLC18A3Q16572 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SLC18A3Q16572 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SLC18A3Q16572 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SLC18A3Q16572 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SLC18A3Q16572 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SLC18A3Q16572 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SLC18A3Q16572 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SLC18A3Q16572 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SLC18A3Q16572 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SLC18A3Q16572 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SLC18A3Q16572 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SLC18A3Q16572 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SLC18A3Q16572 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SLC18A3Q16572 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SLC18A3Q16572 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SLC18A3Q16572 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.1 ms