Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC85BQ15834 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC85BQ15834 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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