Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HERC1Q15751 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HERC1Q15751 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HERC1Q15751 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HERC1Q15751 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HERC1Q15751 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
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