Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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SEC23BQ15437 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SEC23BQ15437 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SEC23BQ15437 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SEC23BQ15437 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SEC23BQ15437 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SEC23BQ15437 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SEC23BQ15437 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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SEC23BQ15437 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SEC23BQ15437 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SEC23BQ15437 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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SEC23BQ15437 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SEC23BQ15437 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SEC23BQ15437 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SEC23BQ15437 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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SEC23BQ15437 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SEC23BQ15437 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SEC23BQ15437 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SEC23BQ15437 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SEC23BQ15437 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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SEC23BQ15437 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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SEC23BQ15437 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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SEC23BQ15437 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
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SEC23BQ15437 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
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SEC23BQ15437 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SEC23BQ15437 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SEC23BQ15437 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SEC23BQ15437 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SEC23BQ15437 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SEC23BQ15437 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SEC23BQ15437 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SEC23BQ15437 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SEC23BQ15437 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SEC23BQ15437 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
SEC23BQ15437 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SEC23BQ15437 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SEC23BQ15437 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SEC23BQ15437 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SEC23BQ15437 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SEC23BQ15437 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SEC23BQ15437 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SEC23BQ15437 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SEC23BQ15437 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SEC23BQ15437 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
SEC23BQ15437 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SEC23BQ15437 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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