Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
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LAPTM4AQ15012 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LAPTM4AQ15012 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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