Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NCAPHQ15003 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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NCAPHQ15003 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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NCAPHQ15003 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NCAPHQ15003 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NCAPHQ15003 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NCAPHQ15003 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NCAPHQ15003 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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NCAPHQ15003 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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NCAPHQ15003 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NCAPHQ15003 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NCAPHQ15003 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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NCAPHQ15003 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NCAPHQ15003 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NCAPHQ15003 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NCAPHQ15003 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NCAPHQ15003 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NCAPHQ15003 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
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NCAPHQ15003 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NCAPHQ15003 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NCAPHQ15003 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NCAPHQ15003 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NCAPHQ15003 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NCAPHQ15003 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NCAPHQ15003 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NCAPHQ15003 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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NCAPHQ15003 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NCAPHQ15003 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NCAPHQ15003 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NCAPHQ15003 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NCAPHQ15003 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NCAPHQ15003 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NCAPHQ15003 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NCAPHQ15003 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NCAPHQ15003 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NCAPHQ15003 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NCAPHQ15003 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NCAPHQ15003 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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