Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL19A1Q14993 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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